后，张献忠改成都为西京，正式建立大西国，改元大顺，以崇祯十七年为大顺元年，置内阁和六部，对前明投顺官吏加以任用，以汪兆龄为内阁大学士兼左丞相，严锡命为大学士兼右丞相。
大西政权建立后，张献忠即开始经营四川，招揽流民，恢复生产，他严厉镇压横暴地方的前明官绅和地主，在大西军内部则严格约束士卒，不许淫掠，对违纪者有由“捆打”至“枭示”的处罚。同时张献忠还命令释放前明狱中囚犯，将各府县的库金银赈济流民。张献忠的这些措施使得四川人心短时间内得以安定，过去曾受前明官绅地主压迫的奴仆或纷起暴动响应大西军，或向大西政权的地方官府告发故主罪状，使其受到制裁。
同年，张献忠改革大西军制，特设大西军各部为120营，每营都设总兵。齐豪更由张献忠亲自点名提为这120名总兵官之一，其顶头上司便是大西皇帝义子、定北将军艾能奇。
大西军经营四川期间，李自成领导的大顺军已在清军进攻下逐渐败亡。清军占领黄河流域各省后，分兵南下。伪清顺治二年，清廷派人入川向张献忠招降，被张献忠以己为汉人绝不降虏严加拒绝，并召集文武计议抗清，恢复中原。
顺治三年八月，清肃亲王豪格统兵逾