阁大学士苏观生门下听用。岂料绍武政权立国之初就没有把抗清放在首位，相反，为了争夺帝统，和刚刚建立的永历政权互相火并，兵戎相见。结果被清军渔翁得利，十一月，清军在李成栋的率领下攻破惠州、潮州，直向广州进发。十二月十四日，清军以十四骑伪称援兵赚开城门，大队蜂拥而入。苏观生急召雷先楚等人抵敌，不敌，城陷，绍武帝及苏观生等皆自缢殉国。
再次大难不死的雷先楚从广州逃出后，打着死也不降清的主意又西投永历朝廷任命的高、廉、雷、琼四府巡抚张孝起，时张孝起正苦于手下没有将材，见雷先楚是正经大明卫所军官出身，又屡次兴勤王之事，便委之为雷州游击。