同是洪武五年，春，征虏大将军徐达领兵穿越戈壁远征蒙古，他与蒙古政权下最大的武装势力扩廓帖木儿的大军在外蒙古相遇并展开决战，但这次徐达的远征遭到惨败，明军损失“无虑数千万”。
战败之后，大明被迫接受与蒙古人的军事对峙，明军也与蒙古政权开始了永久的边境保卫战。而大明军队与蒙古部落的边境斗争在后来几乎贯穿了整个大明王朝，蒙古政权也似乎从未被大明统治者彻底征服过。
洪武五年之前，明军又征服了三个省，山西、陕西和四川。四川是明朝获得的最后一块领土，明军对四川的征服并没有使他们在西南开创个新的安稳的时代，相反的是，明军后头对西部和南部地区的非汉族的其他民族开展了一系列绥靖战役。
洪武五年，因徐达战败，朱元璋的雄心在这场惨败的战役中受到抑制，他放弃了他曾经试图争夺整个外蒙古地域的宏图霸业与远大构想。
同年，洪武皇帝不再主要关心军事问题，他过去准备征服整个元帝国的军事理念开始收缩，明王朝对蒙古的军事行动开始采取守势，明朝以他们新修建的长城为依托，防守着以悍马和骑兵见长的蒙古军队。
朱元璋的武力征服道路已经基本完结，他现在需