海域的镇戍及东部太平洋群岛的探查，下辖新晋、纳闽、长岛港、山（打根）港、马（尼拉）港、桑（切斯将军）城等六个镇守府和九个巡航船中队、七个军输船中队、六个信报船中队；
第九舰队负责东印度群岛东部海域及方丈周边海域的巡防并探索衣洲以东岛域，下辖安汶、万鸦老、巴厘巴板、衣洲港、方丈南港、方丈东港、方丈西港等七个镇守府和十二个巡航船中队、十一个军输船中队以及七个信报船中队；
第十舰队负责东印度群岛东部海域、马六甲海峡、苏门答腊南部海域的镇戍和巡航，下辖凌牙门、普吉、槟城、椰城（巴达维亚）、泗水、马辰、坤甸等七个镇守府和六个巡洋舰中队、十一个巡航船中队、九个军输船中队以及六个信报船中队；
第十一舰队负责东天竺洋海域的巡防及对东非海岸并阿拉伯沿海地区的探索，下辖缅南、吉大港、东天竺、贾夫纳、马累等五个镇守府和四个巡洋舰中队、五个巡航船中队、五个军输船中队以及六个信报船中队。
这次水师改制中除了舰队的变化巨大之外，另外一个显著的变动就在于固化了中队的规模：一般而言，巡洋舰中队和巡航船中队都编有两艘主力军舰和一艘二等信报船；信报船中队则单独下辖两