乱，这场叛乱规模远比永历三十六年的那一次更大，面对处处有警的形势，郑克臧当即大开杀戒。尚未完全整编好的各师奉命轮流出击，在一个月的时间内彻底剿灭了二十一个社，逼迫另外三十三个社向玉山山脉深处搬迁，此外还有一百零五个社在青壮大量被杀后被迫再度臣服，在受到缩减了社区的处分后勉强保留了下来，只有二百四十七个社或摄于郑军的武力或汉化程度较高的原因未做反乱才得以保全。经此一变郑克臧不但彻底将台湾西岸平原地带的平埔社番纳入王化，而且还从平埔番手中夺取了近四千五百甲的熟田，相比四百余人的伤亡可谓收获颇丰。
就在社番哀鸿遍野之时，英圭黎商馆悄然复馆，郑克臧以归还飞霆号为代价，从英圭黎人手中接受了三千名黑奴的补偿，待这批免费的黑奴及部分曾在甘蔗园内劳动的黑奴编入各师之后，郑克臧批准原昆仑标中班长、冲锋官以下四百名伤残及一部分有功的奴军除役，并慷慨的授予其金兰湾附近土地。
四月末，郑克臧又以迁往南北两路的近万户罪民屯民以及千余抽调充任牌长甲首保正的家庭为基础在浊水溪以北设立彰化县、在打狗溪以东南路安抚司旧地设立屏东县，并降天兴和万年两州为县，至此东宁一共拥有六县二安抚司……