其实在以前，商毅就己经将刑部从六部中独立出来，不属内阁管理，而是直接对皇帝付责，但现在皇帝己经明确不再直接管理朝政了，而且刑部的俱体机够，也需要进行重新制定。
首先是将刑部正式更名为司法部，设司法大臣一名，在司法部以下，设立最高法院、检查院、公安部等机构，司法部门的权力完全独立，可以按照正常的法律程序，对任何人提出公诉。
司法大臣的人选，和内阁相似，也是甴皇帝提名，交国会投票表决，然后由当选的司法大臣付责任命司法部官员，而同样也要在每年年底向国会提交年报告进行审议，但国会对司法部没有弹亥权，但可以由皇帝及内阁向司法部发动不信任投票。
司法部的机构并不复杂，其核是依据的法律，不过目前执法的依据仍然是按《大明例律》来执行，尽管商毅对《大明例律》非常不满意，但就目前来说，这是中国唯一的一部比较完善的法律，只能暂时以《大明例律》来做为执法依据。
其实中国的法律由来以久，从战国时代百家争鸣中，法家一直都是诸子百家中的一股重要力量，尽管自秦汉以来，单纯意义上的法家巳经不存在了，而且历代朝廷都标榜自己是以仁治国，推崇儒治，没有谁会自称是