人员各两班，每班八人，各设一领班。章京参与机要，草拟圣旨，俗称“小军机”。
清代的军机处机构精简，行政效率高。人少精干，遇事不推诿，能迅速处理军国大事。军机处的设立，进一步加强了君主专制制度。皇帝通过军机处，集大权于一身，军机大臣“只供传述缮撰，而不能稍有赞画于其间”。标志君主专制主义中央集权制度进一步发展。
4、六部——清中央的执行机关是六部。各部职责和明朝基本相同。
吏部：负责官吏的管理，考核，升迁等
户部：有十三个司，分别管理各地的收支与报销
礼部：主管国家凶吉大典，教育与考试，招待外宾，宴劳功臣等
兵部：管理天下军政（军令由五军都督府管理）
刑部：管理天下刑名
工部：管理建筑、后勤、水利、制造等
5、理藩院——这是清代创设的一个专门管理边疆少数民族地区事务的中央机构。初设时仅管理蒙古，以后扩大到新疆、青海、西藏、四川等少数民族地区。还兼管对俄交涉等外交事务。其编制与六部基本相同，但官员全由满族、蒙古族人担任，汉人不得参与。理藩院的设置，说明清廷十分注意对