崇祯二十二年九月初五日，前内阁首辅、文华殿大学士、太子太傅温体仁病逝于湖州府家中，相关消息于十日后由锦衣卫传到京师，朱由检闻讯大恸，当即下旨罢朝三日以示哀悼。
在跟温俨交代完后世之后没几天，温体仁病情迅速恶化，虽然御医方维信、李少华随后便赶到温家，并竭尽所能对其展开救治，但终因其年事已高，气疾之症诱发并发症，最终医治无效于当日戌时盍然而逝，享年七十六岁。
临终前，温体仁已经口不能言，但看向两位御医的浑浊眼神里似有某种期盼，早就得了朱由检吩咐的方维信俯身在其耳边轻声说了四个字：“配享太庙”后，温体仁脸上露出了如释重负的表情后，含笑咽下最后一口气。
九月十八日，朱由检下旨：遣礼部右侍郎李晓率员赴湖州温家吊唁，丧葬银五千银币；皇明周报于显著位置看法讣告极其生平；追赠温体仁皇极殿大学士衔，追授荣国公，谥文忠，并于皇帝百年后配享太庙。
鉴于移民工作繁复琐碎，非熟知详情者难以胜任，故襄阳知府温侃夺情留任，准其于衙宅服丧十日。
前首辅离世的消息传出后，在关于温体仁身后该享何等谥号，以及有无资格配享太庙的问题上，朝堂上出现了不小的争论