鬼水军作为信长伊势征伐的先导，对在攻灭北田氏的战斗中立下大功。被授予志摩一国作为奖赏。
织田信长信长平定了伊势以后，他九鬼嘉隆作为船手大将随信长转战各地。天正二年征讨伊势长岛一向一揆的战斗中。出动了大小军船三百艘，辎重船三百艘。嘉隆指挥大型军舰的舰队，用大铁炮打破了一揆军重兵把守的篠桥和大鸟居砦。并且使用大型的军船封锁敌人的海上补给线。为歼灭长岛一向一揆的战斗做出了巨大的贡献。
九鬼家的水军无论是声望还是实力，此刻都到达了巅峰。
但是，织田家消灭长岛地区的一向一揆武装，并没有使石山本愿寺门徒众的士气低落。长岛合战的结果，反而刺激了他们反抗的决心。
当时，石山本愿寺与中国地方称雄的毛利辉元是同盟。本愿寺笼城的人数庞大的门徒众的后勤补之所以能够维持，就是因为其背后支持他们的毛利水军以及纪伊杂贺水军强大的的海上运送力量。当时的毛利、纪伊水军掌握了山阳地方直至大阪湾的广大海域的制海权。织田军如果要攻破石山本愿寺，就一定要击败敌人的水军，掌握制海权，切断石山本愿寺的补给线。
天正四年七月，织田方的真锅主马兵卫和沼野伊贺守率河内