停止嘉靖为博孝名强行施行的明睿宗，也就是明世宗本生父兴献王的明堂配享之礼。
朱载坖重用徐阶、李春芳、高拱等内阁辅臣，致力于解决困扰朝局多年的“南倭北虏”问题，采纳内阁大学士高拱、张居正的建议，与蒙古俺答议和，是为隆庆议和，并有俺答封贡。
隆庆元年，公元1567年，朱载坖宣布废除海禁，允许民间私人远贩东西二洋，史称隆庆开关。
朱载坖力行节俭，信用内阁辅臣，并不加以掣肘，但也不能制止内阁辅臣之间的倾轧，这也与其本人仁厚而平庸的性格有关。
从他的做法，我们似乎又看到了明孝宗朱佑樘的再世。
朱载坖即位后，倚靠高拱、陈以勤、张居正等潜邸旧臣，一改嘉靖帝时期的做法，实行革弊施新的政策，使朝政为之一振。革弊，即平反冤狱，宣布“自正德十六年（1521年）以后，至嘉靖四十五年（1566年）十二月以前，谏言得罪诸臣”，“存者召用，没者恤录”。罢除一切斋醮，撤西苑内大高玄殿、国明等阁、玉熙等宫及诸亭台斋醮所立匾额，停止因斋醮而开征的加派及部分织造、采买。加强对官吏的考察，即使一般不予考察的王府官员也在考察之列。廉政官员给予奖赏和提拔，贪官