不知是要坚持“真理”，还是要维护自己内阁首辅的权威，杨廷和第二天竟仍然要求朱厚熜以太子之礼入城登基，礼部给出的章程也没多少改动。朱厚熜自然极力反对，并表示礼部如果执意不改变章程，他就拒绝进城。
正在双方僵持不下之际，一直沉默的张太后出面调停了，她下了一道懿旨，让群臣改在行宫中上表劝进，说白了就是让礼部改用迎接皇帝的礼仪，将新君迎接进宫即位。
太后占着名分大义，以杨廷和为首的一众文臣只好作出让步，即日在行宫中上了劝进表，朱厚熜这才同意摆驾进城入宫。之前议定的章程是从东安门入城，在文华殿即位的，不过现在改成从大明门进城，然后在奉天殿即位。
大明正德十六年，四月二十六日，朱厚熜在百官的见证下在奉天殿宣告即位，颁布登极诏书，改明年为嘉靖元年。登极诏书是杨廷和等内阁大臣早就议定好的，长达8800句之多，涉及60多个事项，自然都是些革故鼎新，笼络民心的举措。
譬如：正德年间，由于直言劝谏而被贬降的官员，全部官复原职，死了的便追封加赏后人；正德朝的大小传奉官（不经科举，皇帝直接任命的官员），全部革职；裁减宫中多余的太监，清除军队中冒籍人