新落成的崇文书院坐落在谷城南街的一条巷子里，这条巷子就叫枣刺巷，整条巷子都被书院包下，因巷子内种有枣树而得名。
巷子的东院是住宿区，西园是学习区。
这里的条件跟平凉比起来相差甚远，但是比起征战途中的临时驻地不知好了多少倍了。
崇文书院现有学子八百二十三人，教职人员一百五十八人，有一大半的教职人员都是崇文学院的毕业生。
高峻山是崇文书院的山长（校长），原山长黄叙主动让贤，自降为第一副山长，副山长还有孙元化、朱之瑜、方以智。
朱之瑜、方以智是由侯朝宗引荐过来的，这两位是明末著名的教育家、哲学家和科学家。
崇文学院也是要分班级的，按照入学的时间来分，一共有三个级，分别是：崇祯六年级、崇祯八年级、崇祯十年级，简称六年级、八年级、十年级；六年级有二个班，八年级有四个班，十年级有六个班。
因为是按照时间来分的，所以六年级是高年级，八年级是中年级，十年级是低年级。
低年级的弟子主要读《小学》、《四书》、《五经》、《周礼》、《太极》、《通书》、《西铭》、《性理》、《资治通鉴纲目》以及