出狱后的赵继统不顾一身被拷打的伤痕，将一纸决斗书贴在了本土防卫军司令部的告知牌上，要和谷寿夫一决生死！本不欲理他，可是天天被人堵着门骂懦夫谁也受不了，谷寿夫只好让人强制将他带离本土交给东条英机“看管”。这一次更多的将领们知道了这个“有脾气”的小家伙。
回到中国他也不安生，联合几位也发声反对谷寿夫的将领继续弹劾，终于在9月12日将他和另外几名大屠杀主犯一起送入预备役，此后也没有担任过任何官职；在日本即将战败前几天才被启用为第59军司令官兼军管区司令官，且未及上任日本**就已宣布无条件投降。
1938年5月，下令关押赵继统的陆相杉山元被赶出中央，由板垣征四郎取而代之，东条英机也取代梅津美治郎担任陆军次官。没了约束的赵继统原本想回到时任第二师团长的冈村宁次身边，没想到冈村接到军部调令，组建侵华日军第十一军，并任该军司令官，负责攻略武汉地区。
就在他申请调入第十一军宪兵队时，控制欲极强的东条英机突然下令，不但恢复了他军事调查部的职务，还调入上海宪兵司令部特高课任代课长还兼任外事课副课长（上海多使馆区，而宪兵系统内懂外语的太少了）。作为组建宪兵特高