电影主要讲述了的是一场跨越了十二年的病毒战争，女主余清是一名医生，同样也是十二年前这场病毒的见证者以及幸存者，在国家因为病毒再度陷入困境的时候，作为医护人员，立即赶往病毒严重的同城进行救助，而也是在同城，她遇到了男主傅蔚，与她同样是来同城救助的医生，两人在这个病毒肆意的城市相知相识，最后走到了一起，在病毒得到控制之后一同撤出同城。
原以为一切都在好转的时候，接踵而至的新一轮更为严重的病毒以及一个尘封了十二年的秘密。
原来余清与傅蔚的缘分并不是在病毒肆意的同城，而是在那个十二年之前的小镇，余清的家乡。
余清自小生活在一个平静安稳的小镇，父亲是镇长，母亲是教师，因着良好的家庭氛围，余清性格温和，成绩斐然，人与她名字一般，清清净净。
在那年本应该是所有初高中学子升学的日子，但是一场巨大的病毒悄然席卷，传播极快的病毒令全国人民陷入无限的恐慌，工作，学业，全部像是被人摁下了暂停键，弥漫着整个小镇的是无穷无尽的消毒水味，但即便如此，咳嗽，呕吐，感染，死亡，还是很快笼罩了这个小镇。
就在这个时候，有一批救助医护人员赶到小镇