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与此同时，孙元化也不甘示弱，紧跟在徐铮后面，上了一本。
莱州府治蓬莱，下辖宁海州、蓬莱、黄山、栖霞、招远、莱阳、文登等县。
孙元化要求增设蓬莱港为对外和对内贸易港口，同时开通朝鲜、日本等国之间贸易往来。
本来孙元化是想按照徐铮的说法，只开展民间贸易的，后来全面衡量，认为最好还是以官方贸易为主，民间贸易为辅，这样一来，可以避免很多意外发生，并可以保证民间商人的利益。
早朝之上，阁臣和大臣们展开了热烈的讨论。
时任礼科给事中卢兆龙是反对的最激烈的一个，
“皇上，此事不可！登莱地区一向是海防要地，本身职责在于守护海防，更何况登莱乃京蓟之门户，一旦开海，鱼蛇混杂，万一西人趁虚而入，岂非直捣京师要地，万万不可！”
工部尚书南居益也持反对意见，
“漕运改海运一事，已经几经兴废，实在是因为海运危险程度太高，一遇飓风大浪，往往船毁人亡，得不偿失，因此尽管海运有诸多优点，但没有舍漕改海，还请陛下慎重考虑！”
徐光启也站了出来，