南京眼下没有“内廷”一说，不过却设有司礼监。司礼监的掌印太监就是当年主动前往夔东游说十三家攻打重庆的太监潘应龙。
潘应龙原先就是永历朝廷的司礼秉笔，早年曾在京中御马监当过差。算起来，崇祯朝的大太监高起潜还是他的义父。不过和义父高起潜比起来，潘应龙身上多了高所不具备的民族气节，也正是因为这一点，定武帝于南京登基后，周士相才让他担任了司礼监掌印。
不过潘应龙这个司礼掌印太监和他的前辈相比，却是名不符实的很。
明制，内阁票拟，司礼批红，内外制衡，遂有内外廷之分。相当长的一段时间***廷的权力甚至还重于外廷，由此产生了许多权倾一时的大太监。如刘瑾、冯保、魏忠贤等。
崇祯帝登基之后，虽诛杀魏忠贤，大办逆案，并且裁撤厂卫，使得内廷再也不能和外朝相抗衡，但直至崇祯帝吊死煤山，内廷都依旧存在，只不过权力不如从前那般大。其间王承恩和高起潜二人，也曾权重一时。
两世为人的周士相虽然对阉人并无歧视，但却也不喜阉人干政，也不想再看到南京的皇城里充斥大量太监，所以即便是不得不重设了几个内廷衙门，也恢复了司礼监这个内廷二十四衙门之首，但