之后被多铎带往北京，但是妻子柳如是不愿跟随，独自一人留在南京。隔了两年，钱谦益因黄毓祺案被清廷拘捕，柳如是四处奔走营救，尔后一直陪着他秘密反清复明。
钱谦益很清楚，十六年来，若不是这位勇敢聪慧的妻子陪伴他，以他怯懦又犹豫的个性，如何能坚持推动“楸枰三局”，让张名振和郑成功多次领兵入长江；没有柳如是的协助，他如何能写出《列朝诗集》等为故国留信史的著作。而今妻子的一句“我不去”，让他颓然地呆坐在椅子上，他很委屈，为何这位粉黛至今惊毳帐的任侠女子，遇事百折不屈的妻子会改变心意，不再支持于他呢。
看着夫君颓丧的模样，望着他那满头白发和苍老的面容，柳如是心下一软，知道自己伤害了夫君。她轻步上前握着夫君的手，柔声道：“牧斋，我们回到虞山去，不再理会这些兴废和存亡，你作诗，我持家，就同寻常人家一样过日子，好吗？”
听着妻子的柔声细语，钱谦益也是心软无比，他叹息道：“河东君，这十多年来我任人辱骂，无行、失节，在虎丘题诗讥讽我“官高依旧老东林”，我为的是什么？...唉，苦恨孤臣一死迟，若是大木就要离去，江南战事再无机会挽回，我怎么也要去见他一面，让他不要走！”