营的太平军伤员和俘虏连同民夫近三千人，被线国安下令全部杀害在独山城外。
独山大败太平军后，线国安以本部精兵一万为先锋迅速东下。太平军第五镇兵力单薄，无法抵挡拥兵数万的线国安，只能在镇将赵自强的指挥下边打边往南丹州城撤。
25日，线国安部在丰宁司击败太平军阻击的第五镇乙旅一部，趁乱以骑兵改换明军旗帜服色，杀入忙着收拢散兵的南丹州城。
驻防南丹州城的第五镇未行抵抗即在镇将赵自强的带领下撤往庆远府城。线国安部占领南丹州城后，连年也不过便带大军向庆远扑去。赵自强命庆远守将卢光祖放弃庆远撤往柳州。
永历十三年元月十一日，清军线国安部前锋杀至柳州北面的雷塘山筑起大营，开始攻略这座西江上的重镇。
至此，广西战局急转直下。
周士相入湖南前所定广西战略乃是计划太平军先行佯攻贵州，步步引诱清军进入广西预设战场作战，至少能在大体相同的兵力条件下开始柳州战役。没想到独山一战第十一镇几乎全军覆没，线国安又快打快进，第五镇仓促之下不断弃地，战个略略部署被完全打乱。
为保柳州，广西巡抚邵九公被迫以本部第四镇、第五镇赵自