凌海将军陈奇策的身后之事办得极其哀荣，因老将军身前并无多少家财，所以周士相拿出3000两银子交与陈奇策长子陈士邦，以用于丧事。与此同时，老将军的遗奏快马送往钦州，由钦州的总督衙门递呈昆明，想必朝廷收到老将军遗奏后会有相应荫赏下来。
丧事结束后，按老将军生前心愿，其部水师正式改编为太平军的水师。周士相命吴远出任水师统制官，实授总兵衔；参将周胜及郑成魁出任水师副统制官，皆授副将衔。老将军的幕僚胡德玉出任肇庆知府，老将军长子陈士邦则出任新会知县，其余子弟周士相也都做了妥善安排，务求不让老将军部下有任何不满。
因老将军事先安排，加上主要将领都愿意依靠越来越强大的太平军，故而肇庆及新会水师的接收整编进行得很是顺利。经清点统计，凌海将军所部共有可用于海战的福船78艘，斗舰、海鹘、走舸等船68艘，此外四百料战座船、四百料巡座船35艘、哨船、沙船等内河船只78艘，另尚有数十艘在建。水师官兵7850人，总兵以下将校52员。
老将军的部下中，参将周胜和郑成魁在老将军尚在之时就曾进言接受太平军改编。前者和清军有灭门之仇，平生所愿便是杀进北京城灭他爱新觉罗全家