之后，城中居民所剩无几，药材更是奇缺，医营郎中所献的防疫方子大多因没有药材缘故而放弃。不过这却难不倒两世为人的周士相，再说那些方子大多是用来治疫，而不是防疫，军中真要生疫，光治又能治得几个，又如何控制疫病不大规模流行开。
太平军五大营连同保安团丁不过两三千众，真要生了疫，战斗力可以说瞬间就会消无，因此周士相对于疫病的解决法子就在于一个“防”字。
掩埋战死将士尸体和清军尸体是首要，其次便是在城中大规模焚城。这个焚城当然不是将新会城一把火烧光，而是捡些密集地区房屋进行焚烧，用高温杀死潜藏其中的病菌。烧过之后再用石灰铺撒，再于营中专门挖掘便溺所在，其他措施如要饮开水，专门设立隔离所在，一旦发现有人有生疫迹象，不管是否为真都行隔离，绝对不允许染疫之人接触他人。种种措施之下，数月以来城中便未生疫。
宋襄公对于周士相防疫的安排自然是赞不绝口，周士相却是无甚居傲，他所采的法子不过是后世再简单不过的措施，只不过时代不同，见识不同这才让今人佩服而矣。
太平军在城中将防疫当做重中之重的工作来做，城外清军却没有将疫病当回事。倒是有人向尚之信提过疫病的问