。顺治元年又兼任刑部参政，率领军队驻防锦州。四月，跟从睿亲王多尔衮入关，大破李自成；又率兵攻略山东、河南，斩李自成的大将赵应元，迫使大顺军万人归顺清朝。顺治二年，跟从豫亲王多铎在潼关大破李自成，随后率大军南下，攻克扬州、南京，然后分兵平定苏州、松江等地，在此过程中，李率泰可谓是双手沾满汉人鲜血。
顺治三年，李率泰跟从端重亲王博洛攻入浙江、福建，因功被封为二等阿达哈哈番兼拖沙喇哈番。顺治五年，郑彩进犯福建漳州、泉州等地，清廷命李率泰与靖南将军陈泰一起剿郑彩，克复长乐、连江二县。郑彩败走时，李率泰又斩获郑彩所任命的总督顾世臣等人。顺治六年，李率泰又北上征讨大同的叛将姜瓖，攻下保德，擒拿姜瓖的党羽牛化麟等人，因功再次加官拖沙喇哈番。
顺治八年，李率泰被调到吏部，官拜弘文院大学士。顺治十年，清廷听从大学士洪承畴的推荐，授李率泰两广总督之职。如今距这位总督大人上任不过数月，上任以后，李率泰相继参劾了一帮在李定国进攻广东时作战不利的文武官员，并且时有和平南、靖南二王抗衡姿势，因其身份，尚可喜和耿继茂都不敢得罪于他。
王爷都这样了，况许尔显这个总兵呢。纵然他