混乱无序的动荡时期，除了少数几股的虫群因为有脑虫的指挥而进退有度外，大部分的虫族都变成被本能支配的无脑虫子。即使如此，业已元气大伤的宇宙联盟依然疲于应付，幸存下来的宇宙公民惶惶不可终日。
这个情况一直持续到来自洪荒星的妖魔、罪恶星的飞羽族以及亡灵军团以不可抵挡摧枯拉朽的绝对实力加入战场，碾压一众虫族。
三年后，最后一支由脑虫率领的虫族被剿灭在原那美亚星域。
但宇宙联盟并没有迎来和平，而是掀起了轰轰烈烈的基因检测运动。因为吃过大亏，所以幸存下来的各级文明绝不愿意见到虫族死灰复燃。而检测结果让所有文明心惊——
除了已经成为历史的泰安联盟几个八级文明外，幸存下来的两个八级文明也不能幸免的发现大量虫族基因携带者。此外，曾经让宇宙联盟仰望的高等种族所有族人更是无一幸免。
面对整个高等种族的疯狂、整个宇宙陷入恐慌的时候，消失了十几万年的坎布拉再现，带走了所有的高等种族。同时，妖魔、飞羽族及亡灵军团也奉深渊之主的命令分别进驻拥有庞大数量的虫族基因携带者的文明，协助各文明的领导者稳定各自的国度，在武力上给予各个公民信心，让虫族基因携