湾）的归属问题，则是由福建总督姚启圣上书，请求任命施琅为福建水师提督，出兵攻台。
原来，早在康熙二十年，明郑（台湾）的当权者郑经就中风而死。郑经一死，明郑的政权自然发生变化。在这场争权夺利中，郑经年仅十二岁的嫡子郑克塽作为棋子，被冯锡范、刘国轩推举继任延平王。
明郑大权被冯锡范、刘国轩，而郑氏官员的向心力也开始动摇，负责与清朝谈和的傅为霖甚至愿当内应。探听清楚这一状况，福建总督姚启圣认为是进攻台湾的好时机，便向康熙帝推荐施琅。而康熙也是敏锐的感觉到此时是收复台湾的好时机，所以才出言让李德全宣诸位大臣前来养心殿议事。
经过商议，大臣们附议了福建总督姚启圣的上书，也认同了擅长水战的施琅为福建水师提督，由他率领福建水师攻打台湾。
康熙二十一年夏（比历史提前一年），康熙康熙以施琅为福建水师提督，出兵攻台，在澎湖大败刘国轩所率领的郑氏海军，随后明郑纳土归降，至此台湾纳入大清版图。
施琅出兵收复台湾后不久，长达十年之久的平三藩之乱也终于接近了尾声。康熙二十一年冬，清军攻破昆明，被康熙骂做逆孙的吴世璠自杀，自此三藩平定。