意与晓组织合作，实则埋伏偷袭，最终双方同归于尽的消息。
当时自来也在震惊的同时，也来雨之国调查过。
发现果然晓组织在那之后，就彻底销声匿迹，这样是促使自来也心灰意冷，离开木叶开始周游世界的原因之一。
直到多年之后，再次听到“晓组织”的名字时，居然发现这是一个与当初的晓组织性质截然相反的恐怖组织！
自来也应该比鼬更早知道晓组织与雨之国的关系，但因为怀疑是有人利用了晓组织的残党，为了不令已故的弟子的心意被践踏，自来也一直希望能够说服晓组织的新首领。
直到最近他发现，晓组织的首领佩恩，似乎也掌握着轮回眼的能力，这才开始怀疑当初长门并没有死，但是却走上了与当初不同的道路……
然而在看到佩恩居然是弥彦之后，自来也却动摇了。
当初长门对“轮回眼”的使用效率并不高，因此自来也对于轮回眼的能力，也并非十分了解。
“究竟发生了什么？我所认识、教导的弥彦，并不是会轻易堕入黑暗的。”自来也看着弥彦说道。
此时自来也更加怀疑，是长门因为某种原因、或许就是在当初山椒鱼半藏的袭击中死亡，将