“鳄-甲”级海岸巡逻艇主要是为海警部队能够更好的执行诸如保护沿海居民、港口、重要军民用设施、无人岛礁等任务而设计的，参照已装备部队多年的内河巡逻艇改进而成。这种内河巡逻艇曾在康凡解救海兰泡大清侨民的行动中使用过，性能很好。新生产的“鳄-甲”级海岸巡逻艇更新了发动机和艇载设备，原型艇上的2挺96式通用机枪得以保留，拆除了艇尾安装的82无后坐力炮，换为一座舰载双管12.7毫米机枪。另外，为了更适于执行长时间的海上巡逻任务，加大了艇上的油箱容积，改善了生活设施。由于改进措施占去了一部分艇上载员舱的空间，舱内只能容纳16名海警官兵，比原型艇少了将近一半。但从该艇所执行的任务性质来看，这种兵力配置也足够了。
而“飞鱼”级巡逻艇是为执行近海防御作战任务设计的，作战对象是敌方的各类作战舰只，与“鳄-甲”级海岸巡逻艇执行的低强度作战任务有着本质的区别，因此其排水量更大、武备更强。该艇满载排水量为160吨，装备2座双管37毫米舰炮、2座双管12.7毫米机枪、4具“鱼叉”鱼雷发射管和2座深水炸弹发射装置以及完善的电子设备，高速增压柴油机双轴推进，最高航速能超过40节，具备全天候作战能