激愤，然而却面对有华夏撑腰的朝廷敢怒不敢言。由此，天皇朝廷用夺自鸟取、福井两个强藩的几十万石知行初步确立了自己的权威。
解决了领地和旗本问题之后，幕府和朝廷接下来进行的谈判就变得顺畅起来。
幕府随后承认天皇朝廷是日本对外的最高象征，天皇拥有接受国书、制定年号、授予朝臣官位、批准各藩联姻及养子继承等方面的权力。不过，天皇不过问具体的朝政处置，相关权力由关白兼左大臣与征夷大将军兼右大臣共同掌握和施行，其中也包括将军奉还的领地及朝廷在西国获得的藩领上的国司、郡司、总地头、地头的任命权。
看起来幕府和朝廷已经取得了一致，“公武合体”即将实现，只是谁都没有想到事情进行到这一步还有变数——由于之前华夏对各地反幕诸侯的许诺，因此公家和幕府不得不接受华夏强加给双方的诸侯会议，并共同承诺今后朝廷的大政国策“悉决于公论”，由此日本的最高权力实际转移到了藩主参议们的手中。
然而藩有大有小，每藩的立场和想法也各自不同，为了均衡强藩与小藩之间的利益，避免某些大藩操纵会议，也是避免小藩联合起来跟强藩作对，所以幕府、朝廷与列藩约定，五万石以下诸侯拥有一票，五万