过随着夏军军输船队的冒险运输，这部分不足万余的百姓和剩下的两个夏军师很快也将撤退完毕。
九月十一日，在夏军主力巡洋舰的护送下，最后一批夏军撤离日照湾。第二天，慑于夏军舰炮威力的清军自日照县城出发，收复了彻底被破坏的夏军海边营砦，藉此象征着山东战事的结束。然而战事的结束却意味着朝争的开始，清廷内部关于是不是要放弃黄河以南的争论开始火爆起来，只是因为康熙对淮安、徐州等要点的意义有着明确的认识，再加上清廷无法壮士断腕般舍弃鲁西、鲁中、鲁南、豫东等地的财税，这才压制一部分朝臣的意见，继续控制整个山东，并以鲁东南沿海为清夏之间的缓冲区。
不过要保证鲁西豫东粮区不受夏军蹂躏，就势必要加强河南前线的力量，因此清军很快就把南援兵团调往汶河一线。可是夏军预判了清军可能的行动，从八月底开始，边陆续向许昌方向增派兵力。尽管这些新建的师战力十分可疑，但是清军并不知道详情，只是知道夏军同样在增兵。
考虑到如此堆砌下去，一来对于财政上的压力太大，二来可能形成最终决战的势态，不敢轻易一搏的康熙不得不主动下令撤退，于是在鲁东南兵团的策应下，清军逐次后退至郑州附近，进而分别退回