二十四日，在周宁、政和等地休整月余的蔡元书部因为补给的问题辗转进入建宁府。涌入的友军固然使得洪拱柱手中的兵力大增，抵抗浙西来犯的清军的把握也大大增强，但是蔡元书部的到来也使得闽西北原本就孱弱的粮食供应体系更加吃紧，再加上两部之间并无直接的统辖关系，在宿地和辎重分配上也多龌龊，不愿此时因为一丝不慎而导致全局变动的洪拱柱便率部退出建宁府城。
可是洪拱柱的退让并没有得到好的结果，因为无法满足欲壑难填的手下，十二月二十八日当晚，蔡部数个营头闹事很快便发展为全军哗变。出面弹压的蔡元书及右福宁师都统制谷永芬等人被叛军杀死，侥幸逃生的左福宁师都统制周正和带伤逃往延平。
此时刚刚率部进入延平休整的洪拱柱得到周正和的飞报，不禁大惊失色，随即顾不得新年在即，点起一师兵马急速北上，趁狂欢中的叛军不备冲入建宁府城，一举平定了乱军。但是经此一变，建宁十室九空，已经不适宜再充当抵御清军进攻的堡垒。不得已，在斩杀了所有的叛军之后，洪拱柱只能在武定元年的正月初一带着所部重新退往南平。
由于闽西北之变还没有传达福州，因此福州城里依旧是张灯结彩、欢天喜地的景象。重返福州的郑克臧再