十月二十二日，郑克臧授命郑军水陆师重占南澳、铜山两岛，并设立南铜都督府，一如思明都督府设置兵力，至此从朱锦西征失败后就丢失了两岛重新回到明郑政权的掌握之中，郑军的匕首进一步的顶在了清廷的胸膛上，以至于闽粤两省误以为郑军的大举进攻就在眼前，两省兵力相继开赴沿海，却没有想到郑军只是虚张声势而已，更让粤北、粤西北的反清义军得到了喘息和转入地下的机会。
十月三十日，郑军再占马江口外马祖列岛及连江定海和福宁霞浦治下的四礵列岛及东冲半岛。这些地区都是清军迁海后留下的空白区，但由于郑军的封海毁盐政策却成了另类繁华的销金地，郑军由此部分实现了以战养战的策略。
“主上，臣以为如今该暂停向大陆进攻了。”营田司司官顾同山向郑克臧一礼后如是进言着。“虽然本藩如今财力暂时无忧，但是粮食却不是立刻能长出来的。”顾同山屈指数着。“各都督府中除了金兰、西归浦、西渤泥三处尚能自给自足外，其余都需藩内支拨，再加上定海府三县、海坛、太平、连江三县的支用，石禄矿区的支用。”顾同山报了个数字。“常平仓的积蓄已经下降到之前的四分之一，虽然有来自暹罗、安南、呔泥等地的稻米补充，要恢复到最初的水平