九月二十五日，赣西义军在各路清军的逼迫下转向东北方向渡过长江，一路攻陷黄梅、宿松闯入安徽境内，安徽绿营多被抽调，一时无力阻挡义军前进，义军得以遁入大别山区。
不过正是由于熊心最终选择进军大别山区，导致了赣西义军的大分裂。一部分不愿远离家乡的义军随后夺路南下，经英山、黄州等地折返阳新，而另一支不愿意苟安的义军则继续北进经霍山、六安、庐州闯入淮上，至于在大别山中继续打着“朱三太子”旗号的义军主力也随后转入豫鄂皖三省交界处。
有人说流寇是明朝覆亡的根本原因之一，这种说法其实是有几分道理的，因为义军也好、反贼也罢，他们原本是农民、小手工业者，如今脱离了土地和产业，本身就不事生产，不但不事生产而且破坏所经过地区的生产，更为可怕的自古都是贼过如梳兵过如洗，杀红眼的官兵会比义军流寇更大的破坏该地区的生产生活，而且官兵是要拿饷的，饷从何来？自然是转嫁到其他没有战乱的地区，以至于全国其他地区的百姓生活也遭到拖累。
如今清廷也遇到了明季时一样的麻烦，自是不敢怠慢，为此清廷再度明发上谕调动援赣的湘省、粤省绿营协助赣省绿营继续堵防追剿南返义军，与此同时调动闽省绿营转