水师获得了一场宝贵的胜利，但对于明郑方面来说并不意味着所有问题都已经解决了。三月初，刘国轩请旨朱锦停文武官员月俸半年，以此厚赐诸军，恢复诸军的战意，朱锦许之，由此思明、海澄一线的郑军士气稍复。
然而新的打击接踵而来，右提督杨贤终因为老迈和耗尽心力在琼州病逝。消息传到思明，朱锦缀朝一日，亲自致哀，然而还没有等他派出接手的大臣，耿精忠便率军再度西征，一举攻下高州、电白等城，守将祖泽清仅以身免。耿精忠乘胜追击，仪卫镇陈庆此时刚刚抵达琼州，根本无力组织北援，于是雷州也落入了耿精忠的手中。
不过耿精忠摄于郑军水师威力，不敢轻易渡海，因此琼州才侥幸无事，然清军势大的消息传到琼州，人心惶惶，部分士绅公然据抗明郑政权的征粮征丁，陈庆和郑省英等对此束手无策，至此琼州的局势恶化，已经无力再为思明提供足够的粮秣物资。
对此，正为重整军队的庞大开销头疼不已的朱锦无可奈何，只能再度祭起加征的法宝，强令思明、海澄、金门三地百姓月输军粮两斗以供开销，由是，原来对明郑方面保有热情的两地百姓逐渐对郑军的存在产生了厌恶和怨怼。
对于朱锦而言唯一的好消息是郑克臧在董国