六月十四日，内阁大学士宋晋奏和局固宜保全，民心未可消失，欲惩擅杀之罪，必究起衅之根，请饬曾国藩速行查明曲直，秉公办理，以释民疑；以长江水师紧要，请饬整顿。从其所奏，命彭玉麟迅速启程，赴江南等省，会同马新贻实心整理长江水师，力除废弛。
六月二十六日，法国兵船进入天津海河。曾国藩闻讯呕吐大作，一病不起。
六月二十八日，以曾国藩病重，命江苏巡抚丁日昌赴津办理教案。因其路远，难以速至，又命工部尚书毛昶熙先赴天津。
是日，谕令李鸿章即带军赶赴京畿驻防。命马新贻迅速安排江苏、上海海口防范事宜。
七月二十四日，丁日昌抵达天津。
七月二十六日，马新贻遇刺，次日死。
八月初三，调直隶总督曾国藩为两江总督，湖广总督李鸿章为直隶总督。
八月初十，曾国藩以病推辞两江总督。不允。
八月二十五日，李鸿章抵达天津。
八月二十九日，命曾国藩等办结天津教案，丁日昌著即速回原任。
九月十一日，曾国藩六十岁生辰，赐御书匾额“勋高柱石”。
九月十八日，命曾国藩进京。