任国民党组织部长，他任命陈果夫为秘书，实际掌控组织部。蒋介石举荐张静江为国民党主席，宋庆龄为副主席，谭延恺为国民政府主席、宋庆龄为副主席的议案也获得通过；苏俄对这个提案显得很满意，也坚定了他们与蒋介石合作下去的决心。蒋介石出任军事委员会主席，他登上了中国权力的最高峰。二中全会召开的同时湖南局势剧变，吴佩孚最终选择出兵湖南，实行两线作战。
吴军出动后，一路势如破竹，唐生智弃守长沙退回衡阳，迭电两广增援；李宗仁从广西到广州大肆游说，共产党方面在中山舰之后也改弦易辙，也在鼓动北伐；但蒋介石现在却不敢北伐，一方面一军地情况还未根本好转，扩军之后，各师都在整顿部队，但时间太短；另一方面，他还感到政治局势不稳，他还没完全掌握住权力，而且二大上庄继华费尽唇舌才通过的三个法案，才制定出一个《私有财产保护法》，因此蒋介石转而反对立刻北伐。
蒋介石反对出兵援湘让李宗仁着急上火，他找到与他关系较好的李济深，没想到李济深也不赞同，他对李宗仁说目前广州局势不稳定，北伐时机未到；李宗仁不赞成，他对李济深说只要你我出兵其他各军就会群起响应。李济深一时没明白，不知李宗仁究竟是何意。李宗仁揭