在北西伯利亚，日本人的日子也逐渐艰难起来，对内外蒙古跟东北的威胁已经降到极低。
日本在东西伯利亚扶植谢苗诺夫组织傀儡政权，企图完全控制此地区。但是，自去年冬天以来，苏俄军队就开始利用日本人对西伯利亚寒冬的不适应，展开了反击战。苏俄军采用游击战，主要从事发动组织群众、壮大游击队伍的工作，并利用日军在冬天雪地中行动困难的有利条件，借助冬寒广泛展开游击活动，到处破坏铁路，切断电话线，给日军很大威胁。
为此，日军不得不集中兵力，先后进行了两次规模较大的讨伐清剿活动。伯格列纳格方面的清剿（1918年9至12月）第十二师团在第二师团的配合下，集中兵力在东西伯利亚的西北部对苏俄游击队进行了清剿，大小战斗几十次，中队（营）一级规模的战斗四至五次。在清剿中，田中中队310人12月25、26日被2000余名游击队包围全歼，日军对苏俄的第一次围剿宣布失败。
今年初的1月，日本位于汉德加的补给营地遭遇苏联偷袭，大量的燃油跟过冬物资被焚毁。军部大怒之下，日本人掀开了第二次对苏俄游击队的围剿（1919年1至4月），因为过冬物资的稀缺，初期日本人只调集了两个联队扫荡东西伯利