校被定名为“国立南京高等航空专门大学”，学制设为三年，招生学员必须经过露州航校培训，或者是各省陆军中学、讲武堂以及普通高级中学毕业生。
南京航空专门大学分为两大学院，其一是军航学院，其二是民航学院。当然，考虑到实际的需要，前者的招生规模要远远超过后者的招生规模。
之所以开办民航学院，自然是为了鼓励和发展民用航空技术的应用。吴绍霆已经打算在世界大战结束之后，由张盛霆公司出资成立中国第一家民航公司，而在这家正式的民航公司成立之前，则由交通部负责成立一个前身的代办公司，负责先行运营飞艇航线。等到民航公司落实之时，再将前身公司收纳合并。
吴绍霆很清楚，不管是客运飞机还是客运飞艇，在短时间内是很难让民众接受和适应的，毕竟民智初开的人们对天空的畏惧根深蒂固，而且空中运输的费用不菲，根本不是普通老百姓消费的起。但是他之所以毅然要成立民航公司，关键不是用来载客，而是开辟空中物流系统，帮助民间商户运输物资，同时提高邮政来往的效率，这一部分内容当然也属于民航事业。
有了空中物流，中国各省各地的联系会更加密切，尤其对南亚殖民地的发展大有帮助。不仅如此，