日本驻沈阳领事馆对此事愤怒至极，虽然大火没有造成人员伤亡，可报社设备、通讯工具、档案全部化为灰烬，短时间之内根本无法恢复运营。做为由日本外务省亲自出资并且暗箱操作的汉文报纸，也是日本在中国唯一的舆论工具，只一天的时间里连续遭到两次攻击，任谁都不可能认为这只是意外。
领事馆立刻把消息发到南京公使馆，公使馆则又马不停蹄的向南京中央政府提请抗议，要求中国赔偿日方的一切损失，尽快缉拿凶手并且给出一个交代。代理外交部长伍廷芳就此事做了一番书面解释，说了一些敷衍的话，随后表示一定会严肃对待。
于是，南京中央政府再次向北京大本营下达命令，要求北京大本营亲自介入调查。
北京大本营秘书长张孝准接到命令，非常高调的派出了两支军方调查小组，分别前往天津和沈阳展开《顺天时报》报馆遇袭案的调查。当然，原本是北京大本营暗中制造的袭击再由自己人去调查，显然是调查不出什么结果。不过张孝准可没打算就这么简单处理，在调查小组临行之前，他曾暗中叮嘱过一定要“调查点什么来”！
二月十二日，国民大会第三部分议程正式结束，除了选举之外也通过了《中华民国宪法》纲要草案