入京都之后，京都城里的二条城里的守卫士兵却拒绝了天皇的命令，四门紧闭，吊桥拉起，一付严阵以待，如临大敌的样子。
二条城是京都城里的一个城中之城，始建于织田信长时代，是当时的将军足利义昭在京都的住所，后来几经毁复，在徳川家康统治了日本之后，下令重修二条城，做为以后历代幕府将军在京都的行辕，后来经过了第三代将军德川家光的扩建，形成了一个东西约五百米、南北约四百米的庞大建筑，虽然规模还比不上京都皇宫，但装饰豪华，犹在皇宫之上，并且建有高达近六米的城墙，平时留有两千士兵驻守，同时也是监视控制皇室的一支力量。
虽然二条城的守军无法阻止天皇向中华军投降，但却可以拒不持行天皇的命令，打开二条城，也向中华军投降。
事实上中华军在京都正愁没有一个立威的机会，来显示一下中华军的武犭，震慑日本的皇室大臣，现在二条城的幕府军队主动把这个机会给送上门来了，那能够不好的利用呢，因此成进一进京都，立刻下令，向二条城发动进攻，而且在开战之前，向全军下令，这一次的战斗不要俘虏，必须将二条城里的守军全部歼灭，也让其他人知道，与中华军做对的下场，同时成进也派人通告天皇绍仁，请他派出