都新开了一个贸易通商口岸，一方面是和中国做生意，另一方面也是希望能够获得中国的支持，来对抗德川幕府。
而南京政府的财政收入到六到七成都与海外贸易有直接或间接关系，虽然与荷兰彻底断决了来往之后，但荷兰是离不开中国的商品，失去台湾，无法直接得到中国的商品之后，荷兰人只能大部份都从日本转手购中国商品，还有一部分是从吕宋购买，因此也导致了南京与日本、吕宋的贸易量也在大幅提高，这样一来，南京的出口量并未减少多少，反正卖谁也是卖，而荷兰的支出，却增加了许多，毕竟中间经也了一道转手。不过也正因为如此，南京方面也不可能完全放弃日本的市场，另外还要通贸易来往，收集日本国内的各种情报、信息，因此对日本各大名的通商请求当然是完全同意。
在杭州定居的日本商团，是南京对日本贸易的总代理，这时也自然也是水涨船高，在日本国内也日益受到重视。日本使团是丰臣氏的余部，后代，当初是在因为在日本实在呆不下去了，到中国仅仅也只是请求政治避，却没想到在商毅的庇护下，居然越混越好，而且一些大名也想得到中国方面的支持，因此也纷纷向日本商团示好，表示自己本来是忠于丰臣家族，只是迫于徳川家族的势力，才不得不