但决不能在这时削弱清廷的力量，现在南京政府和清廷在中原决战，自己只能坐山观虎斗，但决不能趁机出兵，去进攻清廷，那样就只能便宜了商毅。同时还要另想办法，拖商毅的后腿。
另外，自己与清廷决裂之后，也必须要另找势力结盟，否则单靠四川的力量，也不足以与商毅对抗。商毅的战术思想中有一个重要的原则，就是先打弱小之敌，再打强大之敌。而现在看来，清廷是瘦死的骆驼比马大，而南方的三个南明朝廷也紧紧抱团，就是烂船也有三千钉，整个中国似乎就是自己最弱了。而清廷是指望不上，唯一的办法就是加入到南明集团中去，和他们抱成一团。然后再从南方出击，牵制南京政府的后路，虽然也是间接的帮助清廷，但也是在为自己着想。
因此吴三桂就选择了离自己最近的永历朝廷。于是立刻派出使者，向永历朝廷表达了愿意归服的态度。
这时永历朝廷中的吴、楚两党斗争得十分激烈，不过以丁时魁、瞿式耜、何腾蛟等人为首的楚党一方，占据了朝中的重要职位，何腾蛟又掌握着永历朝廷的大部份兵权，因此在权力斗争中占了上风。而吴党一方的干将马吉翔因为拍马有术，是皇帝朱由榔的亲信，有皇帝在背后撑腰，而另一员干将陈邦傅本是南浔总兵