而改任大老酒井忠胜为主将，弟弟保科正之为副将，出动了十五个大名的力量，共计有陆军八万五千多人，水军一万五千多人，战船七百余艘，分从海陆两路，向中国进发。其中战船分为两路，一路付责向中国运送士兵，共有五百艘船，另一路付责进攻中国的东南沿海地区。
而荷兰的巴达维亚当局也出动了六艘荷兰战船，参与日本的海军。三艘帮助日本运兵，三艘付责协助日本作战。
第五卷 飞天篇 第一零一章 清军的援军（三）
日本的船队是以长州、仙台两藩为主组成。
本来长州藩的藩主毛利秀就根本不想参与这一次战斗，因为长州藩一直都是徳川幕府的死敌，而且以前长州藩也和中华军的水军交过战，毛利秀就深知中华军的水军船坚炮利，不是日本水军可比的，而且萨摩藩的下场，就是一个例子。
另一方面，中日通商之后，长州藩虽然没有开设与中国的通商口岸，但日本与荷兰的通商点却是设在长州藩，另外长州藩是日本海运，造船最发达的地区，海运实力强，可以更及日本的沿海岸地区，就是当二手转远，也从中获利甚多，因此长州藩不但不要和南京政府发生冲突，而且还打箅在本藩内也向中国开设一个通商口岸。