船只混乱的时候，向清军发动更为猛烈的攻击。清军这时己全无抵抗之力，船只被一艘一艘的击沉。
与此同时，黄震接到了何滨的报告之后，也立刻下令，第二、三分舰队和海军第五分舰队马上出击，投入到战场中去。不过等商家军的大队船队赶到战场的时候，战事己经接近尾声，清军的船只己被打得伤沉过半，除了少数逃向武昌方向，其余的船只都退进龙山船厂中躲避。
这一战结束之后，商家军一共击沉了清军各种战船四十三艘，俘虏十六艘，船上的物资也全都成为了商家军的战利品，而商家军自身，仅仅只被击沉了二艘护卫舰，另外有三艘船有一定的损伤。不过在混乱中，清军也有十二船侥幸逃出了战场，向武昌的方向行驶而去。清军逃入龙山船厂逃避的船只，己不足五十艘。
取得水战的胜利之后，黄震到并没有急着对龙山船厂发动进攻，因为这时清军在南京地区的水军实力己经十分弱小，对商家军基本构不成任何的危胁了。而且立刻做出布置，命令长江舰队第一、二分舰队逆江而上，赶到和州一带泊驻，一方面是揭制住南京的上游，防备清军从九江方向赶来救援南京，另一方面也是帮助第二军渡江，攻取太平州。海军第五分舰队和长江舰队第三分舰队则仍然