摩船队的实力并不算强，但毕竟是有四十多条战船，在这么快的时间里就取胜，也太快了，到底是因为商家军的实力太强，还是萨摩船队太弱，或者是亚莉桑德拉的指挥能力见长了。
亚莉桑德拉立刻下令，命莫亚和阿尔维斯立刻带领舰队，去收复石垣岛，并且把第二分舰队的七艘辅助战舰都留给他们运送登陆的士兵。而自己则带领着其他的主力战舰去追击萨摩船队的败军，以实现在战前制定目标，全歼萨摩船队。
尽管商家军的战船体和比萨摩船都要大，但速度却要比萨摩船都快得多，而且整体火力也强，因此亚莉桑猿拉也下令，三级以上的战船独立追击，三级以下的战船以二三艘为一组追击。不过萨摩战船虽然是分散逃跑，但却都是向着一个目标，就是宫古岛。因此也十分好追。
从石垣岛到宫古岛之间，也就只有六七十里的距里，在途中又有十余条萨摩船被追上，有两条船因为负隅顽抗，被商家军击沉，其余被追上的萨摩船也都纷纷投降，由商家军的战船押着，回到石垣岛，结果到了后来，只剩亚莉桑德拉带领四艘战船追赶，而萨摩船也剩下不足十艘。
到下午三点钟左右，剩余的萨摩战船逃到了宫古岛海域，但这时宫古岛早己被成刚带领的第三分