劝左良玉起兵的黄澍就是东林一员，而且左良玉在檄文中也把矛头指向马士英，而不是东林党，另外左良玉的大恩人，另一位东林的元老候恂这时也在南京，因此就算左良玉真的打进南京，也不会把东林党怎么样。相反还可以借左良玉的力量，来铲除掉马士英。甚致还有人主张，干脆说动商毅，直接动手把马士英干掉就行了。刘宗周、黄宗羲也扭不过众人，只好来见商毅。
三人见面之后，先客气了一番，黄宗羲道：“此番商军门又在淮安大败清虏，我们也十分欣慰，如今大明只剩这半壁江山，此后抵御清虏，也多倚仗商军门了。”
商毅道：“南雷先生太客气了，这些都是在下份内之事，如今清虏大军压境，但以在下一己之力，要保住这半壁江山，又谈何容易，只有大明君臣精诚团结，齐心协力，筹边制寇方才可成，如果各怀异志，不顾大局，则天下危矣。”
黄宗羲和刘宗周互相看了一眼，黄宗羲道：“商军门可知，如今我大明之祸，并不在外，而在于内。因此筹边制寇，乃在亲君子远小人而已。”
商毅摇了摇头，道：“南雷先生，如令偏安尚未稳。孜孜讨究，应该只有兵饷战守四字，岂能为异同恩怨四字，岂不闻兄弟厥于墙，而外御其侮吗？可况