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而落选的和新加入的预备军合计约还有二千五百多人，商毅将他们也编成三个营，李定国、沈云英，还有另一名原明军的把总刘远报出任三个营的营长。
虽然这一次李定国和沈云英没有参加选拔，但他们都亲眼目睹了商家军选拔正式士兵的全过程，因为整个选拔的过程即严厉而又公平，选上的固然高兴，选不上的也无话可说。只能怨自己平时训练不足。说穿了中国人其实都是不患贫，患不公。因此两人也对商毅佩服的五体投地。
整编完毕之后，商家军的总兵力接近一万六千人，加上预备军和辅兵，总计有两万多人。与刚南下时相比，兵力增加了三成多，对实现商毅立足浙江的目地，基本足够了。
随后商毅才下命，整理钱粮物资。准备东进。
这时南下收获不小，主要是从张献忠身上狠狠的发了一笔横财，共计获得了白银七十余万两，粮食十多万石。不过由于武昌的难民消耗巨大，而且安置居民也花费了巨大的钱粮费用，因此总计花耗了十万多两白银，两万多石粮食。另有马匹近四千匹。这也是商毅要扩大骑军营的重要基础。同时还拥有大小船只一百三十二艘。因为武昌到南京正好是沿江而下，因此商毅也决定，船只用来装运钱粮