战部的四个司也全都筹建完成，以经开始了自主运行。而商毅才把精力转移到行政部这方来。行政部下面的六个司的基本班子都以经组建了起来，其中民政司，财政司，工建司原本就有，人员也基本都是现成的，商毅也比轵放心，而农田司虽然也十分重要，但目前的职责也比较简单，因此也很快就筹备好了。商毅最关心的是教育司，巡检司这两个部门。
教育司担负着陪养后备人材的重要任务，自然不能轻视。按照商毅的要求，八岁以上，十七岁以下的少年，不限男女，都可以免费到学校中学习读书认字数学。现在以有近四千多名少年入学，女学占寥寥无几，还不到百名，同时商毅也考虑到在中国古代的农村家庭里，孩子其实也是家里的一个劳动力，因此学习的时间只定为半天，另外半天还可以帮家里做些事情。
商毅当然不打算把这批少年陪养成只会读四书五经、应考科举的书呆子，但对中国的传统知识也不能放之不理，因此将学习的内容分为两部份，中国传统教育和西方的科学知识。中国传统教育自然是四书五经，同时还加入一些其他经书，如《史记》《资治通鉴》一类。而西方的科学知识暂时只有数学和物理课，其他如地历，天文暂时不考虑，由传教士们拿出一个初步的教学计划