他意识到自己的军权或许太强大了，强大到很多人嫉妒的地步，所以他不得不做出了一些让步。
而且随着蒋介石个人声望的不断上升，蒋介石也意识到自己把持太多东西不好，所以他自己做出了一些让步，那就是辞掉第一军军长的职务，而在别人眼中，一直被视为蒋介石的盟友的汪精卫竟然非常欣慰的同意了。而蒋介石从此只是军事委员会委员，黄埔军校校长，广州卫戍司令等职务。
刘源的职务也稍作调整，被任命为第三师师长刘源本以为，校长大发善心，会给自己一个甲种师，但是后来证明刘源真的想多了，第一师、第二师，虽然是甲种师，但是都没有到满编的地步，更不要说说自己了。
所以第三师，是纯正的乙种师，下辖四个团，有一个直属炮营，配备八门野战火炮，十二门迫击炮。同时还有一个特种大队，对外宣称是特务连。其他还有辎重营等等。看到自己成为师长时候的配置，刘源差点崩溃，这也叫一个师，本来准备找校长哭穷的，但是刘源却得到了一个特殊的任务，那就是成立国民政府属于军方的情报组织。
蒋介石一直认为广州革命政府，没有属于自己的军方情报组织，是一件非常遗憾的事情。而刘源在廖仲恺案上，让特务科