其中，但凡赴日贸易的远洋船只，除了要给日本长崎港纳税之外，还需要给大汉帝国缴纳过境税。
汉帝国和台湾郑经军事集团由盟友走向疏远，再变成尖锐对立，海洋贸易上的矛盾就是其中的主要原因。实际上从一六八六年开始，海军第二舰队就曾和台湾舰队爆发过小规模的海上冲突，之后，冲突的规模和烈度逐年递增，到了一六**年，双方就正式开打了，沿着福建至日本的贸易线，整个大汉帝国海军——包括施琅的第一舰队和杨海生的第二舰队，均多次和台湾舰队爆发过大规模海战，其中最为激烈的就有三次，双方投入的作战舰只均超过两百只，作战兵员达到三万人以上，不过三次海战汉帝国海军均没有取得胜利，但台湾舰队也没有打通对日贸易线，台湾舰队胜在经验丰富、舰队官兵战术能力强悍、各战舰指挥官熟悉战场、个人能力优秀；而汉帝国海军则胜在物资丰富、补给充足、数量庞大、人数众多、火炮性能超过对手，因此双方各有长短，长时期处于对峙状态。
在三次海战之中，其中就有一次战场处于日本海海域，在这次战争之中，江户方面就已经完全倒向了汉帝国，幕府水师作为盟军参加了此次作战，虽然因为力量薄弱的原因无法介入正面战场，但在后勤补给、海域地理