对于这些人，肖天健狠下了心，令各地驻军给予强力镇压，乱世用重典，为了大中朝今后的安宁，一些不肯老实下来的人，就必须要清除掉，所以各地驻军对于这种抵抗，都采取了高压手段，一手抚一手剿，接受招安也就罢了，但是只要有人不接受招安，那么等待他们的便只有凛冽的打击，许多人为此掉了脑袋，甚至于是满门尽灭，但是对于肖天健来说，这是一个新的时代的开始，所必须要付出的鲜血，既然他们不愿意归于大中朝的统治，那么也唯有将他们就此抹去了。
而朝中诸臣对于肖天健的这种狠辣手段，有些人不太赞同，但是肖天健也不跟他们多说什么，现如今大中朝是他的一言堂，有人反对那么就不要再在大中朝为官，为此一批官员为此也丢了官职，被赶回家种田去了，如此一来，朝中反对的声音也就此被肖天健压制了下去。
天元二年的正月就这么在肖天健的忙忙碌碌之中过去，随着西北战事的进行，在正月底的时候，西北传来了一个重大的利好消息。
李自成年前在西北军的强力打击之下，连战连败，损兵折将过半有余，再加上物资的严重匮乏，迫使其不得不弃守了西安府，带着残部逃入了汉中一带苟延残喘。
阎重喜和刘宝督军