为长官，左、右侍郎为副长官，俱满、汉各一人。直接对皇帝负责，尚书之下有左右侍郎（副部长）、郎中（司长）、主事等
3、督察院——直属于皇帝的监察部门。下设左右督御史（正二品）、左右副督御史（正三品）、左右佥督御史（正四品）；再往下设十三道监察御史，分管每个省的检查工作（当时中国分十三个省）十三道监察御史与直属于皇帝的六科给事中统称”科道”属于言官范畴。
4、六科官员——分为吏户礼兵刑工六科，每科设督给事中（正七品）、左右给事中与给事中（从七品）。给事中品级虽低，权利很大，皇帝交给各个衙门办理的工作由六科每五天注销一次，如果有脱拉或者办事不力的，六科可以向皇帝报告。六科还可以参与官员的选拔，皇帝御前会议，审理有罪的官员。最为重要的是六科有封还皇帝敕书的权利，皇帝的旨意如果六科认为不妥可以封还，不予执行。
5、五寺官员——五寺是五衙门的简称，包括大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺、鸿胪寺
6、詹士府——詹士府是负责辅助太子的机构设正三品詹士一人，正四品少詹士一人，正六品府丞一人.詹士府设左右春坊，司经局，主簿厅
7、太医院——