二品，但巡抚多数兼兵部侍郎衔，加衔后为正二品。其职权略逊于总督。巡抚也有直属军队，名为“抚标”。
每一省巡抚之下有布政使，全称为“承宣布政使司”，，一般称“藩司”、藩台或方伯。掌一省之行政，司全省财富之出纳，从二品。
各省有按察使，全称为“提刑按察使司”，俗称“臬司”，掌管一省司法事务，正三品。
藩、臬两司的辅佐官为道员，其职责、设定较为繁复，不能一一赘述，为正四品官。
司道之下的地方行政衙门有府、厅、州、县各级，府的长官为知府，初为正四品，乾隆十八年改为从四品。府下有厅，由同知、通判管理，同知为正五品，通判为正六品。府下还设有州，分为指数布政使的直隶州和由府管辖的散州，长官为知州，前者为正五品，后者为从五品。最下的一级地方长官为知县，正七品。
各省还设有掌管学政、漕运、盐务、河道、税关等衙门。学政为每省一人。管理一省文教事业，由进士出身的侍郎、京堂（各寺堂官）、翰林、科道及部属等官简充，三年一任，各按原官品级。
全国设漕运总督一人，正二品，兼尚书者从一品，有直辖军队“漕标”。
各省设盐政